常见问题

1、请问DNA测序峰图中如果是杂合子的话是不是在某个位点有重叠峰?该位点是不是应该有2个碱基?
测序图谱中的杂合子确实应该有两个叠峰，并且峰高接近1：1，该位点应该有两种碱基例如表示为A/G，但是你要注意分辨杂合子和杂峰的区别，如果测序结果不理想，背景信号比较高，也可能出现叠峰，但是高度肯定远远低于1：1。
2、人的RNaseP基因拷贝数是多少？是2吗？还有其它的基因可以做内参吗？
RNaseP基因拷贝数为2，也是ABI公司CNV试剂盒确定的内参基因，理论上其他基因只要在数据库中拷贝数为2个拷贝，并且没有多态的，都可以成为内参基因。
3、样本量在400份时做2个基因的SNP位点（各2个，共4个）及一个基因的突变位点（2个），用普通的Taqman探针来做这个是否可以？如果做的话存在什么问题？
400个样本使用taqman探针方法实验，成本太高，不合算。而且基因突变的频率比较低，使用taqman方法，会导致3种基因型最后3堆点有2堆几乎没有样本，因此无法进行聚类分析从而实验失败。
4、实验中发现某个蛋白在某个疾病中增高，如何确定这个蛋白的相关基因是否在病人中有突变？
蛋白增高可能是突变造成的，也可能是甲基化等表观遗传学造成的，还可能是microRNA的调控造成的，应该在这三方面进行实验确认蛋白的变化是由何种因素引起。这样的实验在细胞学和病人组织水平上应该同时进行。
5、全基因组扩增无质控的标准怎样的？检验全扩是否均匀？
全基因组扩增的质控标准如下：1、采用阴性对照和阳性对照;2、对扩增产物进行PCR检验，确保扩增产物可以进行PCR;3、保证扩增后DNA的量在1ug以上。
使用全基因组扩增试剂盒扩增后无需进行纯化即可使用，不过全扩后的DNA只适合于SNP,STR和测序研究，不适合进行甲基化或者CNV的研究。