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cDNA常规测序

       以特定组织或者细胞中的mRNA反转录成的cDNA为扩增和测序模板,获取候选基因的突变位点信息,还可检测到引起非正常剪切的功能突变位点。
 
技术方法:
设计特异引物进行全长cDNA扩增,后采用美国Life technologies公司的BigDye试剂盒对纯化后的扩增产物进行测序(同基因组DNA常规测序),如果有多种剪切体,先割胶分离纯化,然后分别测序。与基因组DNA常规测序相比,cDNA测序可以大大减少测序反应数目,节约成本,而且可以检测到引起非正常剪切的明确的功能突变位点,不管该位点是剪切点突变、同义突变还是内含子突变,但是很多情况下,很难获得目标基因表达的组织样本,同时也得注意由于严重等位基因不平衡表达造成的假阴性结果。
 
应用领域:
单基因多基因遗传疾病的基因突变检测、药物代谢相关基因突变检测、肿瘤相关基因的体细胞突变检测等
 
样本要求:
以表达候选基因的总RNA反转录而成的高质量cDNA
 
服务内容:
  1. mRNA反转录成为cDNA;
  2. 候选基因序列查询、全长cDNA扩增及测序引物设计、合成与优化;
  3. 全长cDNA扩增、多种剪切体分离与纯化;
  4. 全长cDNA扩增产物的序列测定;
  5. 判读测序结果,读取突变位点;
  6. 突变位点数据整理、分析以及突变位点测序图制作。
 
服务时间:
通常情况下,<30样本一个基因全长cDNA测序需20个工作日
 
检测实例:
 

cDNA测序原理图
 
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